| 奖励名称 | 奖励人员 | 获奖时间 |
|---|---|---|
| 《数据挖掘》获2011-2012年度校级优秀课程 | 刘莹 | 2012 |
| 高性能计算课程获美国英伟达公司（NVidia）全球教学中心称号，并获奖金和捐赠 | 刘莹 | 2012 |
| 2012年中国科学院院长优秀奖（优秀毕业生奖） | 赵艳平 | 2012 |
| 2012年保罗生物科技优秀学生奖 | 荆中博 | 2012 |
| 中国科学院大学三好学生奖 | 王初照、李苏骁 | 2012 |
| 教育部自然科学奖一等奖 | 石勇 | 2013 |
| “中伦杯”第十一届“学术十星”论文大赛 优秀论文指导老师奖 | 郭琨 | 2013 |
| 中国科学院大学第六届博士后论坛 二等奖 | 郭琨 | 2013 |
| 丰台区创新实践基地 优秀博士后（青年英才） | 郭琨 | 2013 |
| 第五届中国科学院博士后学术年会优秀论文二等奖 | 梁涵 | 2013 |
